题干
高粱是酿酒的优质原料,虫害严重影响高粱产量和品质。将外源抗虫基因导入高粱植株,可培育具有抗虫性状的新品种。回答下列问题: (1)科研人员拟将抗虫基因V连接到图甲中的质粒上,为避免错误连接,应选用图甲中的_____对质粒进行酶切。 (2)将重组质粒导入受体细胞并获得高粱植株,为检测目的基因是否正确导入,以叶片基因组DNA为模板,设计如图乙所示的引物进行PCR及电泳鉴定。其中引物组合为_________的扩增产物电泳迁移速率最快;抗虫基因V的长度约为_____bp。 W试剂:识别G;X试剂:识别G、A; Y试剂:识别C、T;Z试剂:识别C (3)科研人员发现转基因高粱中V基因的表达量未达到预期,推测与启动子部分序列的胞嘧啶甲基化有关。用亚硫酸氢盐(能使未甲基化的碱基C转变为U)处理高粱DNA,将处理后的样品进行PCR扩增等操作获得上述片段的互补链。将所得互补链的末端用32P标记,再分别用四种化学试剂处理,使识别的核苷酸的端磷酸二酯键断裂,并通过控制反应时间使断裂反应不充分进行,然后对四组反应产物进行电泳并检测放射性,化学试剂对碱基的识别情况及检测结果如图丙(只显示含有32P的条带)。③中加入的是__________试剂;a和b两片段长度相差_____个核苷酸;启动子的该序列从端到端第_____位核苷酸发生了甲基化。
答案
(1)Bcl (2) ①. 3+6 ②. 2500 (3) ①. X ②. 4 ③. 3和9
解析
若只用单酶切会出现质粒自连、目的基因反向连接等问题,因此需用两种不同黏性末端的酶,防止错误连接,由图甲可知,BamH I与Bst I识别相同序列(5'-GGATCC-3'),切割后黏性末端一致,因此不能同时选用这两种酶,而且Bst I酶的识别序列位于启动子与终止子的外边,因此不能选用 BamH I酶与Bst I酶。由图示可知,位于启动子与终止子之间的可用限制酶只有Bcl I酶和Xba I酶,二者酶切末端不同,可定向插入V基因,避免质粒自连、目的基因反向连接。 在琼脂糖凝胶电泳中,DNA片段分子量越小,受到的阻力越小,迁移速率越快。结合各组合长度:引物组合1+4扩增产物长度2000bp、引物组合1+5扩增产物长度2800bp、引物组合1+6扩增产物长度4750bp、引物组合2+6扩增产物长度1550bp、引物组合3+6扩增产物长度250bp。其中引物组合3+6扩增产物长度最短,迁移速率最快。抗虫基因V的长度=引物组合1+6扩增产物长度-引物组合1+4扩增产物长度-引物组合3+6扩增产物长度=4750-2000-250=2500bp。 启动子片段为5'-ATCGCGAACG-3'(共10个核苷酸,5'→3'编号为1~10),互补链的5'端被P标记,四种试剂会在识别的碱基处切断3'端磷酸二酯键。电泳后,条带位置代表片段长度,条带缺失说明该位点未被切断(即该位点C发生了甲基化,未被转化为U,无法被识别C/T的试剂切断)。根据条带位置匹配试剂识别的碱基类型:1组:条带位置对应 C/T位点一Y试剂(识别C、T);2组:条带位置仅对应C位点一Z试剂(识别C);3组:条带位置对应A/G位点X试剂(识别G、A);4组:条带位置仅对应G位点一W试剂(识别G)。电泳迁移速率与片段长度成反比,条带位置越靠下,片段越短。从图丙可见,a和b两条带之间间隔了4个核苷酸的位置差,因此二者长度相差4个核苷酸。又由题意可知其序列定位为5'-A1T2C3G4C5G6A7A8C9G10-3',其中C位于第3、5、9位。对比1(Y)和2(Z)的电泳条带,发现第3位C和第9位C处无断裂条带,说明这两个C发生了甲基化,即第3位和第9位核苷酸发生了甲基化。 亲本 F1 F2(数量足够多) 黄毛黑鼻♂*棕毛棕鼻♀ 全为黑毛黑鼻 黑毛黑鼻∶棕毛棕鼻∶黄毛(部分为棕鼻)=9∶3∶4